Emmanuelle a illustré plus d’une vingtaine d’albums pour la jeunesse chez différents éditeurs et cinq ouvrages plus personnels et plus adultes, en signant le texte et les images.
Avec sa palette de feutres vive et franche et son trait expressif, elle développe un style très personnel. Elle déploie un univers fantasmagorique et atypique à mi-chemin entre rêve et réalité. L’étrangeté côtoie la poésie.
Elle a déclaré : «Il s’est passé un tas de trucs merveilleux et épouvantables dans ma vie, comme dans celle de tout le monde. Et c’est ça que je dessine, du merveilleux et de l’épouvantable.»
Dans la filiation de Roland Topor, on peut rapprocher Emmanuelle Houdart de son confrère Stéphane Blanquet.